台湾和港澳是要分开申请的。去当地公安局出入境管理局办理。

港澳通行证到当地公安局办理，办理时有张表格，写明需要签注的次数，在相应的框打勾即可。港澳证两地一证。入台证需要另外办理，也是在公安局，需携带户口本和身份证。

没有港澳台通行证的，只有“港澳通行证”和“大陆居民往来台湾通行证”。这两个证件现在都是卡式的（如同身份证）。在公安局出入境办事处办理，也就是办护照的地方办理。各地对办理条件有细微不同，按照各地要求。一般是携带身份证、在当地办公室拍摄照片、采集生物信息（指纹）缴费。办理证件同时可以申请办理签注。办理签注不需要提供额外材料，缴费就行。