你说的这些地方很分散。微山湖在微山，邻近枣庄，你可以先从商丘坐高铁或普通火车到枣庄，游玩微山。三孔在曲阜，你可以从枣庄坐高铁到曲阜。曲阜离兖州不远，坐普通火车或者汽车半小时就到了。兖州到梁山无直达火车，如果坐火车需要在菏泽转车，有点绕远，可以直接从兖州坐汽车到梁山，车程约2小时。最后梁山到商丘每天4趟直达火车，两个多小时就到了。