城市顺序应该南京-苏州-上海-杭州，这个顺序不绕路。 以下行程供参考： 第一天，飞抵南京。剩下的时间先去秦淮河风光带（中华门城堡、瞻园、老门东、夫子庙、秦淮河游船）。 第二天，上午去中山陵，下午去总统府，晚上可以去1912酒吧街或者逛新街口。（注意，中山陵和总统府周一都不开放，并且中山陵需要提前在网上预约。如遇周一，可以将第二天和第三天的行程对换。） 第三天，去玄武湖和古城墙，去长江大桥公园或燕子矶，逛狮子桥步行街。 第四天，从南京坐高铁到苏州，去拙政园，然后山塘街游玩。 第五天，去寒山寺和虎丘山，晚上逛观前街。 第六天，从苏州坐高铁到上海，可以去看中共一大会址和原世博中国馆（现在是中华艺术宫），晚上在城隍庙吃饭。 第七天，去陆家嘴（东方明珠所在地），然后过黄浦江到外滩，逛南京东路步行街一直到人民广场。 第八天，从上海坐高铁到杭州，去宋城游玩。 第九天，环杭州西湖游玩一整天。 第十天，上午去飞来峰灵隐寺，下午坐飞机返程。

我觉得你可以从云南乘飞机到上海，因为上海有两个机场，而且从市区去机场的交通也比较方便，地铁都可以到达，浦东机场还有磁悬浮，这样往返的机场的时间和效率就比较高。至于线路和时间上，可以安排上海玩三天，苏州玩两天，南京玩三天，杭州玩两天。 第一天到达上海后，可以去上海市区逛逛，例如人民广场、外滩、豫园，晚上去外滩看个夜景。 第二天去上海迪士尼乐园玩一天。 第三天早上乘高铁去苏州，20分钟就可以到达了，到达苏州后，先去拙政园或者狮子林参观，这里两个景点去一个就够了，主要看看江南的园林，下午去虎丘和寒山寺游玩，晚上可以逛逛观前街。 第四天早上去金鸡湖游玩，下午去山塘街，傍晚乘高铁去南京，到达南京后，如果时间早，可以去夫子庙看看，如果时间晚就直接入住酒店吧。 第五天早上可以去总统府参观，下午去玄武湖公园游玩，晚上在夫子庙乘坐秦淮河画舫。 第六天早上去钟山风景区，可以参观中山陵，明孝陵和美龄宫，下午去南京大屠杀纪念馆。 第七天早上去南京博物院参观，下午去雨花台，参观好雨花台后，乘高铁去杭州。 第八天游览西湖，西湖景区很大，还有游船可以去参观三潭印月，基本可以游玩一天时间，如果乘观光车就时间短一点，有时间可以去参观雷峰塔。 第九天早上可以去西溪湿地参观，或者去西湖风景区（山上）参观，下午去宋城千古情，一直可以玩到晚上。 第十天从杭州乘高铁返回上海，在上海的田子坊或者淮海路吃点小吃，再返回云南。

建议走南京——苏州——上海——杭州行程，这样不绕路，城市之间的交通可以是高铁连接。