想要观赏水中生物又怕水不敢潜水，水族馆是个不错的选择。亚庇有两个水族馆，The Green Connection水族馆及位于沙巴大学内的深海水族馆。

The Green Connection水族馆：提供沙巴丰富的生态宝藏展示，详细地介绍热带雨林和珊瑚礁奇观。该水族馆的特色是以生态主题公园的方式，从九个主要的生态栖息地收集五百种以上的本土物种，成为独特的旅游景点之余，也为学校学生提供一个吸取额外知识的教育平台，让参观者更深入了解本州的生态特色。

开放时间：每天早上10时至下午6时

收费标准：成人25RM 2-16岁儿童15RM

交通：可于旺旺山旁的巴士总站乘坐3/4/7号线巴士，1.5RM（6:30-20:00）

计程车15RM左右

网址：www.the-green-connection.com

深海水族馆：这座先进的海洋博物馆是位于马来西亚沙巴大学里的一座新兴建筑。这座深海水族馆具备一切先进的海洋设施及设备，是婆罗洲最好的海洋水族馆之一，设施包括：立式水族展览箱、开放暗礁生物展览中心、浅滩暗礁生物展览中心 、红树林漫步、当代海洋海事博物馆、多媒体交互式讯息问讯处、西巴丹深海潜水窥镜。同时，沙巴大学也是马来西亚最美的大学。

开放时间：星期一、二、四、周末、周日： 上午9：30 – 中午12:30, 下午2：00 – 下午4:30

星期五： 上午9：30 – 中午11:30, 下午2：00 – 下午4:30

星期三与公共假期： 关闭

收费标准：

交通：可于市中心公园公共巴士站乘坐5A号线巴士，1.5RM（6:30-20:00）

计程车18RM左右

网址：www.ums.edu.my