米里-阿拉布神学院位于“卡扬”清真寺对面，建于1530-1536年。神学院为三层建筑，内有教室和许多小室，主要用于伊斯兰僧侣研习之用。其中，小室数目为114个，与《古兰经》章数相同。当时，该座神学院是中亚地区唯一的伊斯兰教神学院，来自中亚各地的伊斯兰教徒都到这里来进行伊斯兰教学术研究。自建成之日起，该神学院就一直从事伊斯兰教学术活动，在苏联时期也未停止过。