相传大约在1405年，朱允炆的叔父，即永乐皇帝朱棣，攻破南京，明惠帝朱允炆逃难至观音崖，受到追兵“靖难军”的攻打，朱允炆藏身此洞30余天，后得以脱险。故取名“藏君洞”。

藏君洞为一大型天然溶洞，溶洞长25000米，已探明洞长4000m，洞内洞中有洞、洞中有河，迂回曲折，地下河流水潺潺，溶洞分布在石炭系中、上统碳酸盐岩中，洞内钟乳石十分丰富：石笋、石柱、石幔、石楼、石像比比皆是。洞内构造奇特，石钟乳千姿百态、绚丽多彩，景观奇秀，珍品奇绝，是我国少有的大型碳酸盐岩岩溶洞穴之一。