澎湖旧称平湖、澎瀛、澎海、西瀛、岛夷和菊岛，在16世纪时被欧洲人称为渔翁岛，其因港外海涛澎湃，港内水静如湖而得名“澎湖”。澎湖于宋代时期被正式纳入中国版图；元朝时设立巡检司；明朝时期荷兰人于1622年占领澎湖，最后明朝以荷兰舰队退出澎湖群岛为条件承认荷兰的台湾岛主权而重新获得澎湖；直到清朝康熙23年(1684年)澎湖才正式纳入清代的中国版图，并在这里先后设立了巡检司、通判；日本统治时期被设为澎湖岛厅，1897年改称澎湖厅；第二次世界大战后设立了澎湖县，并将县治设于马公镇，至1981年马公镇被改制为县辖市。