外部交通：
中国有许多城市开通了直航日本的的航班，一般去本州岛旅游，主要飞往东京、大阪、名古屋，而这次我们在双十一大促买到3098元/2人的日本航空的超值机票，因为考虑到大阪购物比东京便宜，所以也选择上海—东京，大阪—上海的航班，都是中下午的时间飞行，日航的飞机餐非常赞，性价比很高哦！
东京有两大国际机场，分别是距离市区较近的羽田机场和稍远的成田机场，有时会出现在不同机场转机的情况，购票时需特别注意预留交通时间。
大阪分为关西国际机场和大阪国际机场（伊丹机场），关西国际机场负责国际线，伊丹机场负责国内线，距离市区距离更近。两个机场之间有直达大巴连接。
内部交通：
说起日本境内的交通，那是我出行前最头疼的一件事，看了大量的攻略后发现越看越混乱，几近抓狂的状态，因为日本的交通十分发达，拥有密集的铁路、地铁、公路系统以及便捷的飞机、轮渡。其中，城市间移动最主要且方便的方式是铁路；市内交通则透过地下铁及公交。有人说如果你能搞定日本的交通，那你去其他城市都不用害怕了。其实日本铁路看似复杂，但到了日本后我发现只需要用Google地图基本就能搞定一切交通，而且日本的列车都十分准时，所以只要跟着地图显示看清方向和时间其实并没有那么困难。
JR是日本铁道集团（Japan Railway）的简称，也是大部分人在日本旅行中最常接触到的交通运营商。列车按速度及停靠站分为「新干线」、「特急」、「急行」、「快速」和「普通」。
出行前根据你的行程安排你可以提前预定好JR PASS，关于JR PASS分为好多种，这里就不和大家详说了，网上也有很多JR PASS省钱攻略，而我们这次行程并没有购买JR PASS，针对我们这次的行程安排仔细核算过后觉得并没有很划算，所以打算有需要再分段购买
新干线为日本大区域之间移动的主力交通工具，类似我国高铁。其实还没有我们的高铁看起来高大上，而且新干线的价格昂贵，我们从富士山去京都就需要先从河口湖坐巴士到达三岛市，接着从三岛市坐新干线前往京都，大概两个小时时间，一个人的车票需要八百多，还是比较贵的，但是这也是从河口湖去京都最快最省钱的一种方式了。
私铁的范围很广，除了北海道之外全日本都有私铁。大城市如东京和大阪的私铁路线非常多，唯一需要注意的是私铁各有自己的票价系统，同一家公司的线路换乘无需过闸机，但不同公司的换乘就麻烦些，甚至一个地方的车站也会因为铁路公司的不同而分为不同的站。
地铁是日本大城市内部游览的交通担当。不过，除了东京、大阪和名古屋的地铁系统规模较大，其他有地铁的城市线路不多，没有构成网络。通常每个城市都会推出针对游客的优惠套票，游客可视情况购买。
巴士在日本也是经常被利用的一种交通工具。优点是价格低廉，缺点是耗时较长，且受路况影响较大。这次我们全程在东京去河口湖坐了巴士，提前网上预约，然后拿着凭证去新宿车站坐车，发车时间很准时，全程2个小时，河口湖到三岛市也差不多2小时。
公交车游览京都会更加方便，一日公交券是500日元/人，各大景点都有通车，一般从后门上车，下车时提前按铃，通知司机，前门投币后下车。单次乘坐的价格通常在200-300日元，建议还是购买一日券比较实惠。
出租车费用较贵，一旦遇上堵车也不算快捷，因此在公共交通系统发达的大城市里，即便是普通的日本人们也不会随意打车。所以如果没有特殊情况不建议打车，在日本叫出租车需要在出租车搭乘的专用处排队等车。因为日本的所有出租车的车门都是自动的，所以不需要自己开关。下车时不要忘记让司机开发票，因为如果忘记行李或要投诉，可以在发票上查找电话号码和车辆号码。
交通卡：
日本各地都有自己的交通卡，就像国内的IC卡一样，提前充值，无需再排队购票，非常方便。用得比较多的有东京的Suica（也就是西瓜卡）和关西地区的ICOCA。
西瓜卡（ Suica）是东京最常见的公共交通充值卡，不仅适用于一切的交通形式付款，还可以在便利店、置物柜等标示可用SUICA的地方使用，非常方便。可以在机场和各个车站的自动售票机或人工窗口中购买及充值，最小面值为1000日元，其中含有500日元押金，离开日本前可以前往人工窗口退卡，退卡时如果有余额的会扣除220日元手续费，无余额时不扣除，直接退还500日元的押金。
ICOCA是JR西日本公司发行的交通预付费充值卡，和东京地区的Suica类似，适用于关西地区绝大部分公共交通系统，在日本其他地区的JR和电车系统也通用。可以在JR车站人工窗口或自动售票机上购卡。卡内含有500日元押金，可反复充值。离开日本前可前往人工窗口退卡，扣除220日元手续费后，退回卡中余额和押金。
不过我们这次没有购买任何卡，因为发现并不是一直在坐车，很多景点走路便可达到，而且没次坐车买车票也是很方便的一件事，而且东京有推出地铁24/48/72小时的通票，在市内游览基本地铁就可以解决了，所以也是非常划算的，另外还有东京一日游券或者关西周游券这样的优惠套票，可以根据需要自行选择，在很多车站都有售。