而修建于蜈支洲岛中心的妈祖庙的前身是1893年清光绪年间由崖州知府集资在岛上修建的一处取名“海上涵三观”庵堂，后来因为庵堂无人管理，渔民改奉自己的航海保护神妈祖，据说颇为灵验哦！妈祖庙前有一块1995年庙宇复建时出土的龟背石，又称作镇海石或祈福石。当地人传说该石是妈祖降服的巨龟所化，是镇守附近海域的灵石。