坐落于水城西南角，是在古船发掘原址上建设的，是整个水城的精华所在，分为地上和地下两部分。屋顶三艘复原古船采用中国传统造船技术建造，营造出战船停泊在港湾的景象，帆樯林立，蔚为壮观；在博物馆内，会让你仿若穿越时空，感受和聆听古港曾经的繁荣与昌盛。

海底沉船是核心展示内容，主要陈列展览的是1984年和2005年两次水城小海清淤中发掘出土的4艘元、明古船。

很好的一处古船科普博物馆，介绍的很详细，里面的装修设计也很符合主题。对历史感兴趣的可以好好看看。

门口写的是蓬莱古船博物馆，并非登州。

馆内图景配文讲的很有意思，可以了解一下中国的古代航海史。