里耶博物馆最著名的镇馆之宝便是3万9千枚竹简了。2002年的夏季，在里耶的河滩上，发现了一口战国时修建的巨大的古井。在这口大井中，发现了3万9千多枚秦代竹简，是历年发现秦竹简最多的一次。竹简详细记录了这座古城的历史，填补了很多考古空白。最有趣的是，这里的竹简还记载有九九乘法表口诀表。这里确实是一个了解秦朝历史的重要窗口。