藏书楼是大孔祠堂的重要建筑物之一。该建筑为一幢两层楼房，整个建筑群贴近清代官式构图，细微之处反映了浓郁的地方风格，青砖、筒瓦、白灰罩面，飞檐翘壁配饰博脊、合角吻、戗兽、走兽等等，墙体装有成排落地格扇门和槛窗。寝殿内存有孔族中“英雄”孔繁琴效忠清王朝而荣立的“柳州鲤鱼峰击虎碑记”之圣旨“功德碑”和下马碑各一尊，并陈列着孔氏家族已故先祖列宗之木主神位。