安藤忠雄也为这座博物馆设计了特别的黄泉之塔，顺应地形坡度设计了巨大的阶梯，顺着高墙的缓坡慢慢往地底下去，天井成了唯一的光的入口，彷彿真的进入古坟一般，建筑成了大地和历史痕迹的延伸。