普佑寺建于1760年，乾隆皇帝为其母皇太后70寿辰以及庆祝平定回部大小和卓木的叛乱而建。位于普宁寺旁边。1964年，普佑寺因雷击起火，大部分建筑毁于火灾，当时仅存山门及四座配殿。主殿只剩基座。可参观的只有东、西顺山房的罗汉。