长崎孔子庙于明治26年由来自清朝的中国华侨自发捐款建造的孔庙，其中所有琉璃瓦，青白石，孔子像，72圣人像等全部直接来自中国。现在并设中国历史博物馆。建造风格为闽南庙堂风格。颜色鲜艳。楼堂庙宇都是非常福建风格的。当年很多福建人移民到长崎，也产生很久远的影响。