圣约翰要塞最早只是一个葡萄牙式礼拜堂，为纪念施洗者圣约翰而建。荷兰人在18世纪将其重建为堡垒，使其成为防御马六甲古城的重要堡垒。仅有一些残垣断壁和炮台留存至今。