三清殿位于明代丽江土司衙门府邸木府，是木氏土司推崇道家精神的道观，原建在玉音楼旁，多次毁坏，在丽江地震的重建中，修建在木府后花园狮子山上。三清殿占地500平方米，为三重檐尖顶楼阁式木构建筑，殿内供奉道教三清佛像，每天都有人到三清殿来朝拜。