箱根园水族馆分为3块区域，海水馆、淡水馆、海豹馆。海水馆里有鲨鱼、帝企鹅、帝王蟹等。淡水馆里有电鳗、食人鱼等其他大型鱼类。海豹馆里除了海豹，还有各种龟类动物。