虫洞书店所在的花园式别墅是海天堂构的组成部分，此前是一家老别墅咖啡馆，后来厦门投资人苏晓东接过来将其改建为新型复合式书店，其经营模式不是一家单纯意义的书店，而是集图书、时尚、艺术和简餐阅读与旅行空间为一体，图书主要位于一楼，其他楼层囊括了艺术设计和展览等活动。