研究中心在莫高窟广场对面，也可以说是个小型博物馆。由于莫高窟内参观不能拍照，而且很黑看不清楚，那么一定要来此过下瘾。其中，第二层去“敦煌石窟文物陈列”，展出敦煌石窟出土的文物精品，设有敦煌莫高窟的创建，敦煌壁画摹本珍品，敦煌石窟的创建过程和画工绘制洞窟使用过的绘画工具。莫高窟发现的精美的古代丝织物、藏经洞发现的古代写本真迹、敦煌花砖艺术等陈列单元。