卢克索神庙还深埋在尼罗河的淤泥里，阿拉伯人占领后，在此修建了阿布·埃尔·哈加格清真寺。在修建清真寺的时候，卢克索神庙几乎埋在地下，因此就成了该清真寺的地基。等到19世纪挖掘出神庙的全貌时，才发现清真寺竟然凌驾在神庙庭院的废墟上