始建于清乾隆八年（1743年），历经七代活佛精修而成，共耗费白银174多万两。全庙共分五大殿，中为朝克沁（行政教务）殿，两侧分别为拉布楞（活佛）殿，却日（哲学）殿，满巴（医务）殿和珠多都巴（天文数学）殿。 此外，贝子庙周围还有十几座小殿和两千余间喇嘛住宅，贝子庙建成后总面积达1.2平方公里。