整个园区由主入口和主展馆、国内风光、“绿色家园”示范、观赏温室、全国苗木花卉交易、国际友好园、配套服务、接待服务、滨江服务等9大功能区组成。在绿博园可以见到各种形态的景观。在位于中部核心区域的“国内风光”展区,按照我国平原、山地、沙漠、水乡等不同地域特点,结合地形地势营造,各展区设二三个主题；位于园区西部的“绿色家园”展示示范区,以江边漫滩改造为主,营造各种地形,包括疏林草坡、湿地水域、湿地岛景、湿地疏林、沼泽地、湿地花卉园等,形成各具特色的植被景观；由江苏省和南京市的友好省份市县派团组成的国际友好园区与观赏温室展区相邻,将让游客足不出区就能领略异国园林美景。