园内有原生高等植物900余种，其中包括国家重点保护植物高寒水韭、玉龙蕨、桃儿七、珠子参、中甸山楂等。次生植被类型有高山松林、落叶阔叶林、硬叶高山栎林及灌丛、石灰岩山体灌丛、亚高山草甸等。