博洛尼亚大学的主校区坐落在博洛尼亚老城的市中心附近，至今仍在使用。因为博洛尼亚直到19世纪，整个城市都没有做过大的改造，中世纪的城市风貌保留得非常完整。

走廊上高悬着一排排欧洲贵族的家徽，表明这些贵族家庭的子弟世代都是在这所大学里接受教育的，也彰显着这所大学当年的高贵血统。

博洛尼亚大学里有一个必到的地方，那就是世界上第一个解剖室，是一间像小剧场一样的阶梯教室，内部装潢十分精美，天花板上有12星座的雕塑，学生的座椅由高到低围绕着中间的白色石台，这就是当年的解剖台。在中世纪的欧洲，人体解剖被认为是亵渎神灵的行为是被严格禁止的，但是博洛尼亚大学因为得到了特许，可以不受任何权力的影响安排自己的教学，这里进行的解剖实验奠定了当代医学的基础。

从某种意义上说，博洛尼亚大学甚至比这座城市还要有名，在1988年，430所欧洲大学校长共同签署了“欧洲大学宪章”，将博洛尼亚大学正式称为欧洲所有大学的母校，所以博洛尼亚大学也被誉为“大学之母”。但丁、彼德拉克、伊拉斯谟、伽利略、哥白尼等名人都曾在这里学习或执教。