马六甲海事博物馆就在皇家海军博物馆路对面，外形是根据一艘真正的葡萄牙大型远航船“海洋之花号”建造而成，外观气势宏伟庞大，吸引着游客的目光。当年在运送马来西亚的战利品回欧洲时，“海洋之花号”在马六甲海边沉没，马来政府对船只进行修建扩建成展馆。 由于船舱里收藏着许多马六甲的无价之宝，海事博物馆被认为是马六甲遗产的最重要象征之一。 博物馆的橱窗中陈列着马六甲各个时期遗留下来的物品，游客可以亲身感受马六甲历史的变迁。其主要展品有不同历史时期的国旗、雕像、插图、货币、船只模型等，会对马六甲各个历史时期的文化有进一步的认识和提升。