函馆的天主教元町教会与横滨的山手教会、长崎的大浦天主堂并列日本古老的教堂。该教堂内部的圣坛装饰为罗马教宗赠予，精雕细琢，非常豪华珍贵。教堂原为木造建筑，建于1877年，目前的建筑是1924年重建的。教堂外的钟楼有10层楼高，塔尖上有可以祈福避灾的风见鸡，这也是元町地区的标志性建筑。教堂内有一本留言簿，可以用日语写下你的心愿或祈祷，教会在进行弥撒礼拜时，会一同为你祈愿哦。