2008年7月20日胶济铁路实行客货分线运营，新的青州市站于7月20日上午10时正式启用，原青州市火车站改称青州南站，专营货运业务。自7月20日356起，原青州市火车站部分客车停运、停办客运业务，届时所有旅客运输业务将在新火车站办理，地址青州北路北端。铁路上不允许出现同名车站，车站名资源应按先来先得的原则使用，青州市原名益都县，青州市站原名益都站，后青州撤县设市，为区别青州站不致重名，加市以区分。