奇美博物馆的搜藏以西洋艺术、乐器、兵器、动物标本以及化石为主要收藏方向，总计展出约四千多件藏品，约整体搜藏的三分之一。创办人许文龙先生表示：「好的文物不能只是自己欣赏，也要分享给更多人欣赏；搜藏文物不能只是自己喜欢的品味，更重要是大众都能喜欢的风格。」奇美博物馆的常设展展厅介绍如下：【艺术厅】十三至二十世纪之画作，为民众建构西洋艺术发展的时代概念。【动物厅】全球五大洲动物标本及化石搜藏，架构生命演化历程及自然生态。【乐器厅】有「世界民族乐器」、「走入管弦乐团」和「机械音乐家」展区，呈现乐器随文化习俗和科技演进所发展的多种面貌。 「提琴展区」，依全球制琴师传承和地理区为脉络进行系统性搜集，精选经典之作展示。【雕塑大道】古希腊罗马时代至二十世纪雕塑，循历史轨迹串起一条观赏脉络。【兵器厅】展示世界各地古兵器，透过不同类型的兵器呈现工艺及科技的演进。