孔马寺是一座藏传佛教格鲁派寺院，位于四川省甘孜州甘孜县，离甘孜县城有五公里路程，海拔三千七百多米。该寺的前身系噶举派。据历代活佛传记中记载，该寺于藏历第三绕迥时期由第一世噶玛巴图松千巴的大弟子乙格确增创建，迄今已有八百多年的历史，当时为甘孜地区最为兴盛的一座噶举寺庙，相传该寺曾有三万六千多的僧众。但在五世达赖喇嘛时期，因蒙军队的入侵，许多噶举寺庙遭到了破坏，就在这一时期孔马寺改宗成了格鲁派寺庙。1662年，霍尔曲吉把该寺纳入霍尔十三寺之一进行修复。赐名为“孔马寺甘丹桑珠林”即“孔马寺妙善如意洲”。