御碑亭在塔院内，大雄宝殿后面，宋时称御书阁，元时为妙庄严阁，清康熙二十八年(公元1689年)改建为御书亭，至乾隆末年御书亭共有三处，清咸丰年间，均毁。光绪十三年(公元1887年)，江苏巡抚崧骏因康熙、乾隆两帝南巡时均驻跸虎丘，故又动工建亭岩巅，亭内奉有宸墨·今御碑亭之北壁，镌有康熙御诗。