主要奉祀的仙佛是：南海观世音菩萨，同祀的有瑶池金母、虚空地母、准提佛母、九天母娘、骊山老母。配祀中有：中坛元帅、三太子、虎爷。右殿是天上圣母、順天圣母、千里眼、顺风耳。左殿是关圣帝君、玄天上帝、济公师傅、关平太子、周仓将军、福德正神。

有人说花莲的圣修宫属于道教，有人说圣修宫属于佛教，也有人说圣修宫是属于儒教。其实，圣修宫的北投分宫还供奉了玉皇大帝、至圣先师等。所以圣修宫是属于儒、释、道三教合一的一种民間信仰。

圣修宫主要是：供奉五圣恩主，五圣恩主分別是：南天文衡圣帝关恩主羽(关羽)、孚佑帝君吕恩主洞宾(吕洞宾)、精忠武穆王岳恩主飞(岳飞)、九天司命真君张恩主单(张单为灶神，民间说法)、先天豁落灵官王恩主善(王善)。 张单与关公、吕祖师、岳武穆、王灵官共为鸾堂“五恩主”，或称“五圣恩主”。

东汉许慎《五经通义》曰：灶神姓张名单，字子郭；其妇姓王名搏颊，字卿忌。唐代段成式《酉阳杂俎》也说：灶神名唤张单，字子郭，夫人字卿忌，有六个女儿，皆名为察洽。

关圣帝君为三教所共尊，儒教奉为五文昌之一，又尊为“文衡圣帝”、关西夫子；道教奉为“协天大帝”、翊汉天尊；因显圣玉泉山，在佛教又尊为“盖天古佛”。关圣帝君的尊号，系来自于明万历四十二年（１６１４年）因宫中伏魔，敕封为“三界伏魔大帝神威远镇天尊关圣帝君”。

庙里藻井的木雕

木鱼

铜罄（qìng）

供果

救苦救难的--济公活佛

西天取经的--唐僧

镂空雕刻的石柱子和庙门装饰以及庙门前的一对石狮。

圣修宫庙宇，发扬了中国民间的五脊六兽建筑，进一步塑造的是龙飞凤舞，甚至还有男女人物造型，淋漓尽致的各种造型，让庙宇充满活力。充分反映了中国民间建筑的创造和智慧。